uchunguzibg

Jenetiki ya idadi ya watu wa genome kote na ufuatiliaji wa molekuli ya upinzani wa wadudu katika mbu wa Anopheles huko Sebatkilo, Awash, Ethiopia.

Tangu kugunduliwa kwake nchini Djibouti mnamo 2012, mbu wa Asia Anopheles stephensi ameenea katika Pembe ya Afrika. Vekta hii vamizi inaendelea kuenea katika bara zima, na kusababisha tishio kubwa kwa programu za kudhibiti malaria. Mbinu za kudhibiti wadudu, ikiwa ni pamoja na vyandarua vilivyotiwa dawa na unyunyiziaji wa mabaki ya ndani, vimepunguza mzigo wa malaria kwa kiasi kikubwa. Hata hivyo, ongezeko la idadi ya mbu wanaostahimili viuadudu, ikiwa ni pamoja na kundi la Anopheles stephensi, linatatiza juhudi zinazoendelea za kutokomeza malaria. Kuelewa muundo wa idadi ya watu, mtiririko wa jeni kati ya idadi ya watu, na usambazaji wa mabadiliko ya upinzani wa wadudu ni muhimu ili kuongoza mikakati madhubuti ya kudhibiti malaria.
Kuboresha uelewa wetu wa jinsi An. stephensi iliimarika sana katika HOA ni muhimu kutabiri uwezekano wake kuenea kwa maeneo mapya. Jenetiki ya idadi ya watu imetumiwa sana kuchunguza spishi za vekta ili kupata ufahamu kuhusu muundo wa idadi ya watu, uteuzi unaoendelea, na mtiririko wa jeni18,19. Kwa An. stephensi, kusoma muundo wa idadi ya watu na muundo wa jenomu kunaweza kusaidia kufafanua njia yake ya uvamizi na mageuzi yoyote yanayoweza kutokea tangu kuibuka kwake. Mbali na mtiririko wa jeni, uteuzi ni muhimu hasa kwa sababu unaweza kutambua aleli zinazohusishwa na upinzani wa viua wadudu na kutoa mwanga juu ya jinsi aleli hizi zinavyoenea kupitia idadi ya watu20.
Hadi sasa, upimaji wa viashirio vya ukinzani wa viua wadudu na jenetiki ya idadi ya watu katika spishi vamizi ya Anopheles stephensi umepunguzwa kwa jeni chache za wagombea. Kuibuka kwa spishi barani Afrika hakueleweki kikamilifu, lakini nadharia moja ni kwamba ilianzishwa na wanadamu au mifugo. Nadharia zingine ni pamoja na uhamiaji wa umbali mrefu kwa upepo. Nyaraka za Ethiopia zilizotumika katika utafiti huu zilikusanywa katika Awash Sebat Kilo, mji ulioko kilomita 200 mashariki mwa Addis Ababa na kwenye ukanda mkuu wa usafiri kutoka Addis Ababa hadi Djibouti. Awash Sebat Kilo ni eneo lenye maambukizi makubwa ya malaria na lina idadi kubwa ya watu wa Anopheles stephensi, ambao wanaripotiwa kustahimili viua wadudu, na kuifanya kuwa eneo muhimu la kusoma genetics ya Anopheles stephensi8.
Mabadiliko ya upinzani wa viua wadudu kdr L1014F yaligunduliwa kwa kasi ya chini katika wakazi wa Ethiopia na haikutambuliwa katika sampuli za uga wa Kihindi. Mabadiliko haya ya kdr yanatoa upinzani kwa pyrethroids na DDT na iligunduliwa hapo awali katika An. Idadi ya watu waliokusanywa nchini India mwaka wa 2016 na Afghanistan mnamo 2018.31,32 Licha ya ushahidi wa kuenea kwa upinzani wa pareto katika miji yote miwili, mabadiliko ya kdr L1014F hayakugunduliwa katika idadi ya watu wa Mangalore na Bangalore iliyochanganuliwa hapa. Kiwango cha chini cha sehemu za pekee za Ethiopia zilizobeba SNP hii ambazo zilikuwa za heterozygous inaonyesha kuwa mabadiliko yalitokea hivi majuzi katika idadi hii ya watu. Hii inaungwa mkono na utafiti wa awali katika Awash ambao haukupata ushahidi wa mabadiliko ya kdr katika sampuli zilizokusanywa mwaka mmoja kabla ya zile zilizochanganuliwa hapa.18 Hapo awali tulitambua mabadiliko haya ya kdr L1014F katika mzunguko wa chini katika seti ya sampuli kutoka eneo/mwaka huo huo kwa kutumia mbinu ya kugundua amplicon.28 Kwa kuzingatia upinzani wa phenotypic kwenye tovuti za sampuli za kiwango cha chini cha upinzani wa tovuti za sampuli zinaonyesha kuwa mifumo ya upinzani ya tovuti nyingine zote ni alama ya chini ya sampuli ya tovuti ya sampuli. kuwajibika kwa phenotype hii iliyozingatiwa.
Kikwazo cha utafiti huu ni ukosefu wa data ya phenotypic juu ya majibu ya wadudu. Tafiti zaidi zinazojumuisha mpangilio mzima wa jenomu (WGS) au mpangilio wa amplikoni unaolengwa pamoja na uchunguzi wa kibayolojia unaoathiriwa unahitajika ili kuchunguza athari za mabadiliko haya kwenye mwitikio wa viua wadudu. SNP hizi za riwaya za missense ambazo zinaweza kuhusishwa na upinzani zinapaswa kulengwa kwa majaribio ya juu ya molekuli ili kusaidia ufuatiliaji na kuwezesha kazi ya kazi kuelewa na kuthibitisha taratibu zinazowezekana zinazohusiana na phenotypes upinzani.
Kwa muhtasari, utafiti huu unatoa uelewa wa kina wa kinasaba cha idadi ya mbu Anopheles katika mabara yote. Utumiaji wa uchanganuzi wa mpangilio mzima wa jeni (WGS) kwa vikundi vikubwa vya sampuli katika maeneo tofauti ya kijiografia itakuwa muhimu katika kuelewa mtiririko wa jeni na kutambua viashirio vya ukinzani wa viua wadudu. Maarifa haya yatawezesha mamlaka za afya ya umma kufanya maamuzi sahihi katika ufuatiliaji wa vijidudu na matumizi ya viua wadudu.
Tulitumia mbinu mbili kugundua utofauti wa nambari za nakala katika mkusanyiko huu wa data. Kwanza, tulitumia mbinu ya msingi ya chanjo ambayo ililenga makundi ya jeni ya CYP yaliyotambuliwa katika jenomu (Jedwali la Nyongeza S5). Utoaji wa sampuli ulikadiriwa katika maeneo yote ya mkusanyiko na kugawanywa katika vikundi vinne: Ethiopia, mashamba ya India, makoloni ya India na makoloni ya Pakistani. Ufunikaji kwa kila kikundi ulirekebishwa kwa kutumia ulainishaji wa kernel na kisha kupangwa kulingana na kina cha ufunikaji wa jenomu ya wastani kwa kikundi hicho.


Muda wa kutuma: Juni-23-2025