uchunguzibg

Fosforilati huamsha kidhibiti kikuu cha ukuaji DELLA katika Arabidopsis kwa kukuza uhusiano wa histone H2A na kromatini.

Protini za DELLA zimehifadhiwa vizurividhibiti vya ukuajiambazo zina jukumu kuu katika kudhibiti ukuaji wa mimea kwa kukabiliana na dalili za ndani na za kimazingira. DELLA hufanya kazi kama mdhibiti wa unukuzi na huajiriwa kwa walengwa wa promota kwa kufungamana na vipengele vya unukuzi (TFs) na histone H2A kupitia eneo lake la GRAS. Uchunguzi wa hivi karibuni umeonyesha kuwa uthabiti wa DELLA unadhibitiwa baada ya kutafsiriwa kupitia mifumo miwili: uundaji wa ubinikwitini unaosababishwa na gibberellin ya phytohomoni, ambayo husababisha uharibifu wake wa haraka, na muunganiko wa virekebishaji vidogo kama ubiquitin (SUMO) ili kuongeza mkusanyiko wake. Kwa kuongezea, shughuli ya DELLA inadhibitiwa kwa nguvu na glycosylations mbili tofauti: mwingiliano wa DELLA-TF unaimarishwa na O-fucosylation lakini unazuiwa na marekebisho ya N-acetylglucosamine (O-GlcNAc) iliyounganishwa na O. Hata hivyo, jukumu la fosforasi ya DELLA bado halijabainika, kwani tafiti za awali zimeonyesha matokeo yanayokinzana, kuanzia yale yanayoonyesha kuwa fosforasi inakuza au kupunguza uharibifu wa DELLA hadi zingine zinazoonyesha kuwa fosforasi haiathiri uthabiti wake. Hapa, tunatambua maeneo ya fosforasi katika REPRESSORga1-3(RGA, AtDELLA) iliyosafishwa kutoka kwa Arabidopsis thaliana kwa uchambuzi wa spektrometri ya wingi na kuonyesha kwamba fosforasi ya peptidi mbili za RGA katika maeneo ya PolyS na PolyS/T inakuza shughuli ya kufungamana na kuimarishwa kwa H2A RGA. Uhusiano wa RGA na vipandishaji lengwa. Ikumbukwe kwamba fosforasi haiathiri mwingiliano wa RGA-TF au uthabiti wa RGA. Utafiti wetu unaonyesha utaratibu wa molekuli ambao fosforasi huchochea shughuli ya DELLA.
Ili kufafanua jukumu la fosforasi katika kudhibiti utendaji kazi wa DELLA, ni muhimu kutambua maeneo ya fosforasi ya DELLA katika mwili na kufanya uchambuzi wa utendaji kazi katika mimea. Kwa kusafisha ukaribu wa dondoo za mimea ikifuatiwa na uchambuzi wa MS/MS, tulitambua fosforasi kadhaa katika RGA. Chini ya hali ya upungufu wa GA, fosforasi ya RHA huongezeka, lakini fosforasi haiathiri uthabiti wake. Muhimu zaidi, majaribio ya co-IP na ChIP-qPCR yalifunua kwamba fosforasi katika eneo la PolyS/T la RGA inakuza mwingiliano wake na H2A na uhusiano wake na vipandishaji lengwa, na kufichua utaratibu ambao fosforasi huchochea utendaji kazi wa RGA.
RGA huajiriwa kulenga kromatini kupitia mwingiliano wa kikoa kidogo cha LHR1 na TF na kisha hufungamana na H2A kupitia eneo lake la PolyS/T na kikoa kidogo cha PFYRE, na kutengeneza mchanganyiko wa H2A-RGA-TF ili kuleta utulivu wa RGA. Fosforasi ya Pep 2 katika eneo la PolyS/T kati ya kikoa cha DELLA na kikoa cha GRAS na kinasi isiyojulikana huongeza ufungamano wa RGA-H2A. Protini iliyobadilishwa ya rgam2A huondoa fosforasi ya RGA na kupitisha umbo tofauti la protini ili kuingiliana na ufungamano wa H2A. Hii husababisha kuharibika kwa mwingiliano wa muda mfupi wa TF-rgam2A na kutengana kwa rgam2A kutoka kwa kromatini inayolengwa. Mchoro huu unaonyesha ukandamizaji wa unukuzi unaosababishwa na RGA pekee. Mfano kama huo unaweza kuelezewa kwa uanzishaji wa unukuzi unaosababishwa na RGA, isipokuwa kwamba mchanganyiko wa H2A-RGA-TF ungekuza unukuzi wa jeni lengwa na uondoaji wa fosforasi wa rgam2A ungepunguza unukuzi. Mchoro umebadilishwa kutoka kwa Huang et al.21.
Data zote za kiasi zilichambuliwa kitakwimu kwa kutumia Excel, na tofauti kubwa zilibainishwa kwa kutumia jaribio la t la Mwanafunzi. Hakuna mbinu za kitakwimu zilizotumika awali kubaini ukubwa wa sampuli. Hakuna data iliyotengwa kwenye uchanganuzi; jaribio halikuwa nasibu; watafiti hawakuwa vipofu kuhusu usambazaji wa data wakati wa jaribio na tathmini ya matokeo. Ukubwa wa sampuli umeonyeshwa katika hadithi ya takwimu na faili ya data chanzo.
Kwa maelezo zaidi kuhusu muundo wa utafiti, tazama Muhtasari wa Ripoti ya Kwingineko Asilia inayohusiana na makala haya.
Data ya proteomics ya spektrometri ya wingi imechangiwa kwenye muungano wa ProteomeXchange kupitia hazina ya washirika wa PRIDE66 yenye kitambulisho cha seti ya data PXD046004. Data nyingine zote zilizopatikana wakati wa utafiti huu zimewasilishwa katika Taarifa ya Ziada, Faili za Data ya Ziada, na Faili za Data Mbichi. Data chanzo imetolewa kwa ajili ya makala haya.

 

Muda wa chapisho: Novemba-08-2024