uchunguzibg

Phosphorylation huwasha kidhibiti kikuu cha ukuaji cha DELLA katika Arabidopsis kwa kukuza uhusiano wa histone H2A na chromatin.

Protini za DELLA zimehifadhiwa bwanavidhibiti ukuajiambayo ina jukumu kuu katika kudhibiti ukuaji wa mmea katika kukabiliana na dalili za ndani na mazingira. DELLA hufanya kazi kama kidhibiti cha unukuzi na huajiriwa ili kuwalenga waendelezaji kwa kushurutisha vipengele vya unukuzi (TFs) na histone H2A kupitia kikoa chake cha GRAS. Uchunguzi wa hivi majuzi umeonyesha kuwa uthabiti wa DELLA unadhibitiwa baada ya kutafsiriwa kupitia taratibu mbili: polyubiquitination inayochochewa na phytohormone gibberellin, ambayo husababisha uharibifu wake wa haraka, na kuunganishwa kwa virekebishaji vidogo vya ubiquitin-kama (SUMO) ili kuongeza mkusanyiko wake. Kwa kuongeza, shughuli ya DELLA inadhibitiwa kwa nguvu na glycosylations mbili tofauti: mwingiliano wa DELLA-TF huimarishwa na O-fucosylation lakini huzuiwa na urekebishaji wa N-acetylglucosamine (O-GlcNAc) iliyounganishwa na O. Hata hivyo, jukumu la DELLA phosphorylation bado haijulikani, kwani tafiti za awali zimeonyesha matokeo yanayopingana, kuanzia yale yanayoonyesha kwamba phosphorylation inakuza au kupunguza uharibifu wa DELLA kwa wengine kuonyesha kuwa phosphorylation haiathiri utulivu wake. Hapa, tunatambua tovuti za phosphorylation katika REPRESSORga1-3(RGA, AtDELLA) iliyosafishwa kutoka kwa Arabidopsis thaliana kwa uchanganuzi wa spectrometry na kuonyesha kwamba fosforasi ya peptidi mbili za RGA katika maeneo ya PolyS na PolyS/T hukuza shughuli ya kuunganisha na kuimarishwa kwa H2A. Ushirikiano wa RGA na wakuzaji lengwa. Hasa, fosforasi haiathiri mwingiliano wa RGA-TF au uthabiti wa RGA. Utafiti wetu unaonyesha utaratibu wa molekuli ambayo phosphorylation inaleta shughuli za DELLA.
Ili kufafanua jukumu la fosforasi katika kudhibiti utendakazi wa DELLA, ni muhimu kutambua maeneo ya phosphorylation ya DELLA katika vivo na kufanya uchanganuzi wa utendaji katika mimea. Kwa utakaso wa mshikamano wa dondoo za mimea ikifuatiwa na uchanganuzi wa MS/MS, tuligundua fosforasi kadhaa katika RGA. Chini ya hali ya upungufu wa GA, phosphorylation ya RHA huongezeka, lakini phosphorylation haiathiri utulivu wake. Muhimu zaidi, majaribio ya ushirikiano wa IP na ChIP-qPCR yalifichua kuwa fosforasi katika eneo la PolyS/T la RGA hukuza mwingiliano wake na H2A na uhusiano wake na wakuzaji lengwa, ikifichua utaratibu ambao fosfori huchochea utendakazi wa RGA.
RGA inaajiriwa ili kulenga chromatin kupitia mwingiliano wa kikoa kidogo cha LHR1 na TF na kisha kuunganishwa kwa H2A kupitia eneo lake la PolyS/T na kikoa kidogo cha PFYRE, na kuunda tata ya H2A-RGA-TF ili kuleta utulivu wa RGA. Phosphorylation ya Pep 2 katika eneo la PolyS/T kati ya kikoa cha DELLA na kikoa cha GRAS kwa kinase isiyojulikana huongeza kuunganisha kwa RGA-H2A. Protini inayobadilika ya rgam2A hukomesha fosforasi ya RGA na kuchukua upatanisho tofauti wa protini ili kutatiza ufungaji wa H2A. Hii inasababisha kuharibika kwa mwingiliano wa muda mfupi wa TF-rgam2A na kutenganishwa kwa rgam2A kutoka kwa chromatin lengwa. Kielelezo hiki kinaonyesha ukandamizaji wa maandishi wa RGA pekee. Mchoro sawa unaweza kuelezewa kwa uwezeshaji wa unukuu unaopatanishwa na RGA, isipokuwa kwamba mchanganyiko wa H2A-RGA-TF ungekuza unukuzi lengwa wa jeni na dephosphorylation ya rgam2A itapunguza unukuzi. Kielelezo kimerekebishwa kutoka kwa Huang et al.21.
Data zote za kiasi zilichanganuliwa kitakwimu kwa kutumia Excel, na tofauti kubwa zilibainishwa kwa kutumia mtihani wa Mwanafunzi. Hakuna mbinu za takwimu zilizotumiwa kubainisha awali ukubwa wa sampuli. Hakuna data iliyotengwa kutoka kwa uchambuzi; jaribio halikuwa nasibu; watafiti hawakuwa vipofu kwa usambazaji wa data wakati wa majaribio na tathmini ya matokeo. Saizi ya sampuli imeonyeshwa kwenye hadithi ya kielelezo na faili ya data chanzo.
Kwa maelezo zaidi kuhusu muundo wa utafiti, angalia Muhtasari wa Ripoti ya Kwingineko Asili inayohusishwa na makala haya.
Data ya molekuli spectrometry proteomics imechangiwa kwa muungano wa ProteomeXchange kupitia hazina ya washirika wa PRIDE66 yenye kitambulisho cha seti ya data PXD046004. Data nyingine zote zilizopatikana wakati wa utafiti huu zimewasilishwa katika Taarifa za Ziada, Faili za Data za Ziada, na Faili za Data Ghafi. Data ya chanzo imetolewa kwa makala haya.

 

Muda wa kutuma: Nov-08-2024